FastQ Screen: A tool for multi-genome mapping and quality control

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

FQC Dashboard: integrates FastQC results into a web-based, interactive, and extensible FASTQ quality control tool

Summary FQC is software that facilitates quality control of FASTQ files by carrying out a QC protocol using FastQC, parsing results, and aggregating quality metrics into an interactive dashboard designed to richly summarize individual sequencing runs. The dashboard groups samples in dropdowns for navigation among the data sets, utilizes human-readable configuration files to manipulate the pages...

متن کامل

tight frame approximation for multi-frames and super-frames

در این پایان نامه یک مولد برای چند قاب یا ابر قاب تولید شده تحت عمل نمایش یکانی تصویر برای گروه های شمارش پذیر گسسته بررسی خواهد شد. مثال هایی از این قاب ها چند قاب های گابور، ابرقاب های گابور و قاب هایی برای زیرفضاهای انتقال پایاست. نشان می دهیم که مولد چند قاب تنک نرمال شده (ابرقاب) یکتا وجود دارد به طوری که مینیمم فاصله را از ان دارد. همچنین مسایل مشابه برای قاب های دوگان مطرح شده و برخی ...

15 صفحه اول

The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants

FASTQ has emerged as a common file format for sharing sequencing read data combining both the sequence and an associated per base quality score, despite lacking any formal definition to date, and existing in at least three incompatible variants. This article defines the FASTQ format, covering the original Sanger standard, the Solexa/Illumina variants and conversion between them, based on public...

متن کامل

Bacterial genome mapper: A comparative bacterial genome mapping tool

UNLABELLED Recently, next generation sequencing (NGS) technologies have led to a revolutionary increase in sequencing speed and costefficacy. Consequently, a vast number of contigs from many recently sequenced bacterial genomes remain to be accurately mapped and annotated, requiring the development of more convenient bioinformatics programs. In this paper, we present a newly developed web-based...

متن کامل

QUAST: quality assessment tool for genome assemblies

SUMMARY Limitations of genome sequencing techniques have led to dozens of assembly algorithms, none of which is perfect. A number of methods for comparing assemblers have been developed, but none is yet a recognized benchmark. Further, most existing methods for comparing assemblies are only applicable to new assemblies of finished genomes; the problem of evaluating assemblies of previously unse...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: F1000Research

سال: 2018

ISSN: 2046-1402

DOI: 10.12688/f1000research.15931.1